Město stojící na poloostrově, kam se dostanete jen přes několik zvedacích mostů. Jeho poloha je typickou pro bretonské přístavy, jedná se tedy o dlouhý skalnatý poloostrov vysunutý doprostřed divokých a skalnatých mělčin. Podobně byly založeny i leckteré další pevnosti jako jsou Brest, Lorient nebo Mont Saint Michel. Z moře byly prakticky nedobytné - za odlivu se přes skalnaté mělčiny nikdo neodváží a za přílivu se sem dostane jen loď s mělkým dnem a šikovným lodivodem, který tu to dobře zná. Ze souše to jde jen po úzké šíji, která byla často navíc překopána a město spojeno s okolím jen dobře hájitelnými dřevěnými mosty. Tyto pevnosti byly nepřekonatelným oříškem pro Římany a po osazení hradeb římskými metacími stroji si svou nedobytnost udržely po celý středověk.
Město mělo strategický význam - jako přístav proti Anglii - a stalo se slavným také díky množství francouzských korzárů, kteří zde kotvili a vyplouvali odtud do světa. Předkové mnoha Kanaďanů se kdysi do nového světa přeplavili právě na jejich lodích. Pro tuto vojenskou důležitost byly v sedmnáctém století hradby zcela přestavěny slavným stavitelem Vaubanem a došlo k postavení bastionů, kurtin a hlavně dokonalého systému několika předsunutých pevností kolem města. Ty jsou dodnes přístupné pouze z města a pouze za odlivu po úzkém, uměle vyvýšeném, chodníčku. Dnes to samozřejmě jde i malou mělkou pramičkou za přílivu. Na větší lodě je tu mělko a hlavně všude z vody čouhají jako nůž ostré skály. Předsunuté pevnosti byly vybaveny dalekonosnými děly a žádnému nepříteli se tak nepodařilo se dostat aspoň na dostřel města - děla z pevností ho udržela uctivě daleko.
Výše popisovanou nedobytnost však bohužel využili i nacisté a Saint Malo bránili do posledního dechu. Ukázalo se, že ani použití moderních zbraní nepomůže při zdolání Vaubanovy pevnosti a tak Američané několik dnů město bombardovali zápalnými bombami. Sám Vauban jednou napsal, že ačkoli bude útočníky svádět k dobývání z moře, lze ho dobýt z jediného směru ze souše. Německý velitel asi Vaubana nečetl, protože tuto slabinu města nechal Američanům odkrytou a tímto směrem bylo město nakonec dobyto. Výsledek bojů byl každopádně otřesný - při bombardování i následných bojích zahynuly spousty civilistů a celé město zůstalo ležet ve spálených sutinách. Ale ti, kdo přežili, následně celé město s velkou pomocí Kanaďanů postavili znovu.